H Κισσόνεργα είναι μια κοινότητα με ιστορία χιλιάδων χρόνων και πέντε αιώνων, η οποία βρίσκεται όλα αυτά τα χρόνια στην ίδια ακριβώς θέση. Οι πρώτοι κάτοικοι έφτασαν στο χωριό την χαλκολιθική εποχή, όπως φαίνεται από τα αρχαιολογικά ευρήματα στις τοποθεσίες Μυλούδκια και Μοσφύλια. Περισσότερα: Αρχαιότητες. Πιστεύεται πως η κατοίκηση από τότε μέχρι σήμερα είναι συνεχής, την ύπαρξη πάντως του χωριού ως κοινότητα μαρτυρούν μεταγενέστερες γραπτές πηγές του 16ου αιώνα, συγκεκριμένα επίσημα έγγραφα της Βενετιάς. 

Την ύπαρξη οικισμού κατά τα βυζαντινά χρόνια βεβαιώνουν τα βυζαντινά νομίσματα που ανευρέθηκαν στα Μοσφύλια και στη Ν.Δ. παραθαλάσσια περιοχή. Από την περίοδο της φραγκοκρατίας μέχρι την Αγγλική κατοχή, η Κισσόνεργα  υπέφερε από την εκμετάλλευση και καταπίεση των εκάστοτε κατακτητών, όπως και οι υπόλοιπες αγροτικές κοινότητες του νησιού.

Πηγές:
Κλεάνθης Ι. Βάκης, Η Κισσόνεργα ανά τους αιώνες, Λευκωσία  2003
Μεγάλη Κυπριακή Εγκυκλοπαίδεια